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文献
The Sequence Manipulation Suite Copyright © 2000, 2004 Paul Stothard. Send questions and comments to stothard@ualberta.ca
蛋白序列模糊查找工具 - SMS2
蛋白序列模糊查找工具按照类似BLAST的方法在目标序列中搜索相似的子串,并按照相似度从高到低返回相似子串。
输入原始序列或者FASTA格式序列,长度限定在2000以内。
>test sequence GKGKYGLEAFNGKFVQTDGQLAGTANEQTQFTLIFTSGHLVLRDNNGRHLGVDSGTRVLK SSKPGLTKANYFILEDSCPQGAFEFGGKYASLKQGEDVSFKLLVDEDIEDTETFQLEFVE TDKYAIRVCDPKKNSRDAKFWKTVAAGIQANGNSKDQTDCQFSVEYNGNDMHVRAPGGKY
输入需要模糊查找的子串,长度限定在30以内。
使用此工具之前,请详细了解
浏览器兼容性
要求.
Use the following parameters to specify how hits are scored, and to control which hits are returned.
打分矩阵
PAM30
PAM70
BLOSUM80
BLOSUM62
BLOSUM45
跳配得
5
4
3
2
1
0
-1
-2
-3
-4
-5
分
显示前
40
30
20
10
9
8
7
6
5
4
3
2
1
个
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引用文献
Thu Aug 27 17:17:36 2015